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生物信息學(xué)（序列搜尋比對(duì)分析）
計(jì)算為整數(shù)計(jì)算，基本無浮點(diǎn)計(jì)算； 計(jì)算的主要特點(diǎn)為頻繁的load 和write（內(nèi)存的讀寫），意味著需要較大的內(nèi)存容量和內(nèi)存帶寬， 需要直連架構(gòu)CPU；網(wǎng)絡(luò)的壓力不大，用最高性價(jià)比的千兆網(wǎng)，而不需求使用具有較高價(jià)格的Infiniband高速網(wǎng)。
分子動(dòng)力學(xué)
主要是浮點(diǎn)計(jì)算為主 ，非常適合大規(guī)模并行，但是對(duì)網(wǎng)絡(luò)需求比較大，節(jié)點(diǎn)間需要使用低延時(shí)，高帶寬的Infiniband高速網(wǎng)。
分子對(duì)接（藥物設(shè)計(jì)）
計(jì)算量非常大，消耗計(jì)算機(jī)時(shí)很多；網(wǎng)絡(luò)的性能要求不高，擴(kuò)展性主要看看配體小分子的數(shù)量和它們計(jì)算規(guī)模的均勻性。
測(cè)序儀離線處理
相比計(jì)算量，存儲(chǔ)容量需求更大；作業(yè)運(yùn)行需要與作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)結(jié)合； 測(cè)序離線處理往往有序列拼接的需求,目前最主流的序列拼接軟件denovo為多線程程序,單節(jié)點(diǎn)內(nèi)存容量需求非常大,往往需要達(dá)到256G甚至512GB,需要配置大容量?jī)?nèi)存SMP胖節(jié)點(diǎn)。
電子顯微鏡圖象處理
主要為浮點(diǎn)計(jì)算,其中大量的單精度FFT計(jì)算；軟件加速比完全線性,對(duì)網(wǎng)絡(luò)依賴低； 軟件內(nèi)存需求和IO需求較大,一般需要配置并行文件系統(tǒng)； 系統(tǒng)計(jì)算量大，計(jì)算時(shí)間長(zhǎng)，系統(tǒng)穩(wěn)定性，可靠性要求高。
質(zhì)譜儀原始資料處理
軟件加速比接近線性,對(duì)網(wǎng)絡(luò)依賴低；系統(tǒng)計(jì)算量大，計(jì)算時(shí)間長(zhǎng)，系統(tǒng)穩(wěn)定性，可靠性要求高。
寶德生命科學(xué)高性能計(jì)算集群是一個(gè)有機(jī)的、高性能、高可靠性的集群系統(tǒng)。系統(tǒng)的硬件都選用經(jīng)過嚴(yán)格測(cè)試的主流產(chǎn)品，保證系統(tǒng)的可靠性；互聯(lián)系統(tǒng)各組件的網(wǎng)絡(luò)都是專用的高效網(wǎng)，通過集群核心的管理系統(tǒng)使得整個(gè)系統(tǒng)協(xié)調(diào)一致的運(yùn)行，如單獨(dú)的一臺(tái)高性能計(jì)算機(jī)一樣為用戶提供統(tǒng)一的服務(wù)。
該集群向用戶提供一個(gè)單一計(jì)算機(jī)的界面。前置計(jì)算機(jī)負(fù)責(zé)與用戶交互，并在接受用戶提交的計(jì)算任務(wù)后通過調(diào)度器程序?qū)⑷蝿?wù)分配給各個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)執(zhí)行；運(yùn)行結(jié)束后通過前置計(jì)算機(jī)將結(jié)果返回給用戶。程序運(yùn)行過程中的進(jìn)程間通信通過專用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行。
? 方案計(jì)算系統(tǒng)的選擇實(shí)現(xiàn)了多樣化，該方案配置10個(gè)寶德自研的雙路八核刀片服務(wù)器PR8020P。刀片式集群系統(tǒng)在計(jì)算密度、功耗散熱、運(yùn)營(yíng)成本、維護(hù)成本、可靠性等方面，都明顯優(yōu)于其它系統(tǒng)，且為系統(tǒng)的擴(kuò)容升級(jí)提供了良好的基礎(chǔ)。
? 計(jì)算系統(tǒng)也可采用寶德高性能PR2510P雙路服務(wù)器，注重浮點(diǎn)峰值和內(nèi)存性能。對(duì)于大內(nèi)存的需求，采用寶德自研八路PR8800G SMP服務(wù)器，采用了因特爾至強(qiáng)E7 v4處理器。
? 互聯(lián)系統(tǒng)各組件的網(wǎng)絡(luò)都是專用的高效網(wǎng)絡(luò)，通過集群核心的管理系統(tǒng)使得整個(gè)系統(tǒng)協(xié)調(diào)一致的運(yùn)行。
能為苛刻的生命科學(xué)計(jì)算提供高浮點(diǎn)運(yùn)算性能，計(jì)算集群可靈活采用多種計(jì)算系統(tǒng)
計(jì)算網(wǎng)絡(luò)采用高速的EDR 100Gb IB網(wǎng)絡(luò)互聯(lián)，確保用戶的計(jì)算任務(wù)在運(yùn)行過程中不受網(wǎng)絡(luò)帶寬的限制，延遲低速度快。兩層高速網(wǎng)絡(luò)保障集群中所有節(jié)點(diǎn)無阻塞、全線速的運(yùn)行，可充分滿足高速互聯(lián)的需求。
主要產(chǎn)品都采用了冗余設(shè)計(jì)（電源、風(fēng)扇等），存儲(chǔ)系統(tǒng)采用雙鏈路冗余設(shè)計(jì)，系統(tǒng)的可靠性有較高保證
GPU節(jié)點(diǎn)、存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)、計(jì)算節(jié)點(diǎn)等有很高的擴(kuò)展性，既能滿足現(xiàn)階段的業(yè)務(wù)要求，也能更具未來業(yè)務(wù)量的增長(zhǎng)進(jìn)行升級(jí)和擴(kuò)容。
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